SuperFootPrint大小鼠步態(tài)分析系統(tǒng)原理及設備介紹
上海欣軟,可信賴的動物行為實驗專家 |
SuperFootPrint大小鼠步態(tài)分析系統(tǒng)原理及設備介紹 |
1.步態(tài)分析系統(tǒng)硬件結構布局 動物步態(tài)分析系統(tǒng)硬件的布局,下方安裝有高頻攝像頭的大小為130cm×9cm×6cm大小鼠跑臺,跑道上方設有紅色背景光照射裝置,玻璃跑道側方射入綠色熒光。 2. 高速高分辨率的圖像采集系統(tǒng) 工業(yè)高清晰電荷耦合器件(Charge Coupled Device, CCD)攝像頭,采集分辨率為768*576像素,其距離定位精度約為1mm;采樣速度100幀/秒。 3. 動物步行跑臺 本步態(tài)分析系統(tǒng)實現(xiàn)動物雙通道訓練及檢測,從而為今后藥效評價中所需的大樣本量需求提供可靠保證,且系統(tǒng)雙通道寬度可隨動物大小進行調(diào)整,以適應不同品系、月齡、體重的動物。 4. 動物誘導箱 為了高效率高質(zhì)量的完成動物步態(tài)測試,加入誘導箱設計,誘導箱中放入動物平時飼養(yǎng)所用的飼養(yǎng)箱,以便動物通過前期訓練后習慣性的順利不間斷的通過步態(tài)測試跑道,進入放有飼養(yǎng)籠的誘導箱內(nèi)。 5. 背光裝置 應用紅色發(fā)光二極管(Light Emitting Diode, LED)燈制作燈箱,燈箱寬度覆蓋這個跑道,通過紅色的背景光,可將動物輪廓清晰的體現(xiàn)出來。 6. 足跡增強系統(tǒng) 側光足跡增強系統(tǒng),應用綠色LED燈,將均勻的綠色熒光射入玻璃側面,達到玻璃體中充滿綠色熒光,*終可實現(xiàn)動物足跡圖像增強的效果,便于電腦軟件對動物行走時四肢的自動識別。 其中,老鼠步行通道、高速攝像機、足跡增強板、背景增強系統(tǒng)、誘導箱安裝在用鋁型材加工的支架上,用于實現(xiàn)實驗動物在足跡增強板上行走過程中足跡的提取,誘導箱為實驗動物提供熟悉的小環(huán)境,使實驗動物經(jīng)過訓練后,能夠在足跡增強板上正常行走,方便完成足跡提取。高速攝像機與視頻采集分析計算機用網(wǎng)線連接,通過計算機的千兆網(wǎng)卡實現(xiàn)圖像數(shù)據(jù)采集。 7. 步態(tài)視頻分析軟件 步態(tài)視頻分析軟件模塊為步態(tài)分析軟件的核心部分,而其中的步態(tài)自動識別功能又是是本系統(tǒng)的核心模塊,該功能模塊主要包括:圖像降噪預處理子模塊、虛假目標剔除子模塊、步跡分離增強子模塊、時序跟蹤子模塊、聚類分析子模塊、指標分析子模塊等。其中降噪子模塊主要利用濾波算法,降低因為光線變化引起的足跡提取誤差;虛假目標剔除子模塊主要是對于老鼠行走過程中引起的虛假目標(如老鼠糞便等)進行剔除;步跡分離增強子模塊針對紅綠藍三通道數(shù)據(jù),根據(jù)其顯著性自動剔除其中信噪比較低的通道,利用差圖像法和QTSU二值化算法,自動提取足跡區(qū)域;時序跟蹤子模塊和聚類分析子模塊主要是對單幀提取的足跡區(qū)域,先進行聚類,然后根據(jù)時序關系自動識別左右前后四個爪子,并進行標記,為下一幀分析提供依據(jù);指標分析子模塊根據(jù)各個步態(tài)指標的物理意義,自動分析相應指標。*終,通過軟件自動識別動物腳印,可得到步態(tài)相關的各個方面信息,如距離方面,時間方面,體態(tài)方面,壓力方面和速度方面。 7. 步態(tài)評價指標 步 行 周 期:動物行走時一側足跟著地到該側足跟再次著地的過程被稱為一個步行周期,一個步行周 期可分為支撐相(Stance Phase)和擺動相(Swing Phase); 支 撐 時 長:在一個步行周期中始終與地接觸的階段; 擺 動 時 長:在一個步行周期中始終與地無接觸的階段; 支 撐 時 相:支撐時長所占步態(tài)周期的百分數(shù)(Cycle%)作為單位來表達; 單支撐時相:通常指一足著地到該足離地的過程; 雙支撐時相:在一個步行周期中產(chǎn)生的雙足同時著地的階段; 三支撐時相:在一個步行周期中產(chǎn)生的三足同時著地的階段; 擺 動 時 相:擺動時長所占步態(tài)周期的百分數(shù)(Cycle%)作為單位來表達; 制 動 時 長:從該足開始接觸時刻到該足與地面*大接觸面積時刻所需的時長; 制 動 指 數(shù):制動時長/支撐時長; 推 進 時 長:從該足與地面*大接觸面積時刻到該足離地時刻所需的時長; 推 進 指 數(shù):推進時長/支撐時長; 同源協(xié)調(diào)性:被觀測足爪(RH or LH)的擺動時間或支撐時間與對照足爪(LH or LF)的步行周期的比值 同側協(xié)調(diào)性:被觀測足爪(RH or LH)的擺動時間或支撐時間與對照足爪(RF or LF)的步行周期的比值 對側協(xié)調(diào)性:被觀測足爪(RH or LH)的擺動時間或支撐時間與對照足爪(LF or RF)的步行周期的比值 步 幅:動物在一個步行周期中,同一前肢或后肢連續(xù)兩個*大腳印橫坐標中點之間的距離; 左 側 步 基:動物在一個步行周期中,左前肢連續(xù)兩個*大腳印橫坐標中點與左后肢連續(xù)兩個*大腳 印橫坐標中點之間的距離; 右 側 步 基:同上; 前 肢 步 寬:在行走中左、右兩足間的距離稱為步寬,通常以足爪中點為測量參考點; 后 肢 步 寬:同上; 足跡*大面積:t為足爪接觸地面的*大面積時刻; 足跡平均面積:每幀圖像足跡面積之和/總幀數(shù); 足跡*大強度:t為足爪接觸地面的*大強度時刻; 足跡平均強度:每幀圖像足跡強度之和/總幀數(shù); 擺 動 速 度:步長/擺動時間; 瞬 時 速 度:每只爪子的步長/步行周期; 總 速 度:在一次行走過程中,步長的總和/步長周期的總和; 平均體轉(zhuǎn)角:老鼠嘴尖與尾根形成的軸線的方向和正前方向軸之間的夾角的平均值,比如老鼠移動的 方向偏離正前方向5°; 體轉(zhuǎn)角標準偏差:老鼠嘴尖與尾根形成的軸線方向和正前方向軸之間的夾角的標準偏差,比如如果老鼠的 平均體轉(zhuǎn)角為5°,標準偏差為3°,那么代表動物有在2-8°的范圍內(nèi)運動的趨勢; 平均側向移動:動物質(zhì)量中心延Y軸側向移動的距離; 側向移動標準偏差:動物質(zhì)量中心延Y軸側向移動的標準偏差。 |