水迷宮重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的方差分析及其在SPSS中的實(shí)現(xiàn)
目的:介紹用SPSS 11.0實(shí)現(xiàn)對(duì)水迷宮重復(fù)測(cè)量資料的方差分析,以期對(duì)采用重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)方案的臨床和基礎(chǔ)科研工作者提供可借鑒的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析方法。
方法:應(yīng)用SPSS 11.0中一般線性模型(general linear model, GLM)的repeated measures和multivariate過程對(duì)水迷宮重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)進(jìn)行重復(fù)測(cè)量方差分析和多元方差分析,并進(jìn)行不同時(shí)間點(diǎn)和不同組間的兩兩比較。
結(jié)果:首先通過球形檢驗(yàn)(Mauchly’s test of sphericity)的結(jié)果判斷重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)之間是否存在相關(guān)性,如存在相關(guān)性(P≤0.05),宜進(jìn)行多元方差分析,或采用Greenhouse-Geisser的校正結(jié)果;通過計(jì)算個(gè)體間(between-subject)變異,可分析處理因素有無效應(yīng);計(jì)算個(gè)體內(nèi)(within-subject)變異,可分析時(shí)間因素有無效應(yīng),時(shí)間與處理因素之間有無交互效應(yīng);使用重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)多重比較配對(duì)的t檢驗(yàn)法(Bonferroni法),可進(jìn)行每個(gè)分組每個(gè)時(shí)間點(diǎn)上作用的兩兩比較;使用多元方差分析的方法,可進(jìn)行每個(gè)時(shí)間點(diǎn)上每個(gè)分組之間作用的兩兩比較。
結(jié)論:對(duì)于重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的方差分析,宜采用一般線性模型的重復(fù)測(cè)量過程方法進(jìn)行分析。SPSS統(tǒng)計(jì)軟件易于實(shí)現(xiàn)重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的方差分析。
關(guān)鍵詞:方差分析; 統(tǒng)計(jì)學(xué); SPSS; 線性模型
在中醫(yī)藥防治老年性癡呆的作用機(jī)制研究中,為了動(dòng)態(tài)觀察**對(duì)癡呆大鼠空間記憶能力的改善情況,可測(cè)量大鼠在**前后不同時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行水迷宮實(shí)驗(yàn)的潛伏期數(shù)據(jù),此類設(shè)計(jì)屬重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)。不少研究者對(duì)此類資料的分析都采用一般類型實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)資料的單因素方差分析甚至t檢驗(yàn)等不妥當(dāng)?shù)姆椒?,而沒有考慮到該指標(biāo)在不同時(shí)間點(diǎn)上的關(guān)聯(lián)性或該指標(biāo)隨時(shí)間變化的趨勢(shì)。許多統(tǒng)計(jì)學(xué)教科書對(duì)重復(fù)測(cè)量資料的方差分析方法有論述但不**,特別是方差分析有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義時(shí)對(duì)其后的進(jìn)一步在不同時(shí)點(diǎn)或不同組間兩兩比較的方法較少介紹。我們數(shù)年前曾進(jìn)行中藥調(diào)心方防治Alzheimer型癡呆(Alzheimer dementia, AD)作用機(jī)制的實(shí)驗(yàn)研究[1]。其中水迷宮重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的分析是用SAS軟件完成的。但SAS軟件過于專業(yè)化,且必須通過編程才能完成運(yùn)算,一般人不易掌握。近年來SPSS統(tǒng)計(jì)軟件以它的普及實(shí)用性和**的窗口菜單式操作界面贏得廣大醫(yī)務(wù)工作者和科研人員的青睞。在此以一實(shí)例介紹用SPSS 11.0實(shí)現(xiàn)對(duì)水迷宮重復(fù)測(cè)量資料的方差分析,以期對(duì)研究中采用重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)方案的臨床和基礎(chǔ)科研工作者提供可借鑒的統(tǒng)計(jì)分析方法。
1 資料和方法
1.1 資料來源 本文資料來源于國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目“中藥防治老年性癡呆的機(jī)理研究”(No. 39830450),為我們數(shù)年前進(jìn)行中藥調(diào)心方對(duì)氧化損傷類AD大鼠“有害網(wǎng)絡(luò)”作用的實(shí)驗(yàn)研究中的部分實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。
1.2 動(dòng)物及分組 SD雄性大鼠,體質(zhì)量(200±10)g,隨機(jī)分為5組:正常對(duì)照組、假手術(shù)組、模型組、模型+中藥調(diào)心方組(簡(jiǎn)稱調(diào)心方組)和模型+西藥Aricept組(簡(jiǎn)稱Aricept組)。
1.3 空間記憶能力測(cè)試 采用Morris水迷宮法。平臺(tái)設(shè)于迷宮西南象限正中,水面高出平臺(tái)1.5 cm,水溫保持在19~20 ℃,大鼠每天訓(xùn)練2次,分別從正北和正東兩個(gè)起始點(diǎn)投放,設(shè)定*長游動(dòng)時(shí)限為70 s,以秒表計(jì)時(shí),記錄大鼠找到平臺(tái)所需要的時(shí)間,或稱潛伏期(latency)。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 首先對(duì)重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)在各時(shí)間點(diǎn)之間的關(guān)系是否滿足Huynh-Feldt條件進(jìn)行球形檢驗(yàn)(Mauchly’s test of sphericity),當(dāng)檢驗(yàn)的結(jié)果為P>0.05時(shí),說明重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)之間實(shí)際上不存在相關(guān)性,資料滿足Huynh-Feldt條件,可以用重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)資料的單變量方差分析處理資料;反之,當(dāng)P≤0.05時(shí),表明資料不滿足Huynh-Feldt條件,此時(shí)需采用校正方法對(duì)單變量方差分析進(jìn)行校正,或?qū)母鲿r(shí)間點(diǎn)上測(cè)得的數(shù)據(jù)視為測(cè)自不同的指標(biāo),采用多變量方差分析。還可進(jìn)一步考察各時(shí)間點(diǎn)上數(shù)據(jù)之間是否具有某種特殊關(guān)系(稱為協(xié)方差結(jié)構(gòu)),從而采用更細(xì)致的混合模型分析法。本文主要討論用一般線性模型(general linear model, GLM)的重復(fù)測(cè)量過程實(shí)現(xiàn)重復(fù)測(cè)量資料的單變量方差分析,并用多因素方差分析過程實(shí)現(xiàn)每個(gè)時(shí)間點(diǎn)上組間的兩兩比較。數(shù)據(jù)文件格式:每個(gè)變量按列記錄。以group變量表示資料的分組(1~5分別代表正常對(duì)照組、假手術(shù)組、AD模型組、調(diào)心方組和Aricept組),以day 11和day 12、day 21和day 22、day 31和day 32、day 41和day 42、day 51和day 52變量分別代表5 d中每天兩次測(cè)量的潛伏期數(shù)據(jù)。并求出每天兩次測(cè)量結(jié)果的算術(shù)平均值分別以day 1~day 5五個(gè)變量存入數(shù)據(jù)文件中。
2 分析步驟及結(jié)果
2.1 通過球形檢驗(yàn)的結(jié)果 判斷重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)之間是否存在相關(guān)性球形檢驗(yàn)的結(jié)果P<0.01,說明5次重復(fù)測(cè)量的數(shù)據(jù)間存在高度的相關(guān)性,宜用多元方差分析進(jìn)行檢驗(yàn)或按表右側(cè)給出的3種校正方法對(duì)一元方差分析進(jìn)行校正(校正系數(shù)為Epsilon)。一般推薦使用Greenhouse-Geisser的校正結(jié)果。
2.2 分析時(shí)間、分組因素的作用以及時(shí)間和分組之間的交互作用 重復(fù)測(cè)量資料的單變量方差分析較一般類型實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)資料的方差分析要復(fù)雜一些,由于由個(gè)體形成的區(qū)組因素與處理因素之間存在包含關(guān)系,需要從其中分解出反映個(gè)體間變異的部分作為度量處理因素效應(yīng)大小的誤差項(xiàng);而度量“時(shí)間因素”和“處理與時(shí)間之間的交互作用”效應(yīng)的大小時(shí),需要用個(gè)體內(nèi)(within-subject)變異部分算得的結(jié)果作為誤差項(xiàng)。
個(gè)體內(nèi)變異部分的計(jì)算結(jié)果顯示,時(shí)間因素(day)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),說明測(cè)量指標(biāo)(潛伏期)有隨時(shí)間變化的趨勢(shì);但時(shí)間和分組的交互作用(day×group)沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),說明時(shí)間因素的作用不隨著分組的不同而不同。
個(gè)體間變異部分的計(jì)算結(jié)果顯示,group的P值小于0.05,說明分組因素起作用,各組潛伏期指標(biāo)總體而言不同。
2.3 每個(gè)時(shí)間點(diǎn)上5個(gè)分組之間的兩兩比較 與正常組比較,假手術(shù)組大鼠潛伏期無顯著變化,提示假手術(shù)對(duì)大鼠空間學(xué)習(xí)記憶能力無明顯影響;AD模型鼠潛伏期則顯著延長(P<0.05),提示AD模型鼠空間學(xué)習(xí)記憶能力出現(xiàn)障礙,調(diào)心方和Aricept對(duì)AD模型鼠延長的潛伏期有顯著的改善作用(P<0.05)。見表4。其分析步驟如下:Data→Split Files選中Analyze all cases, do not create groups (取消對(duì)數(shù)據(jù)文件的拆分)Analyze→General linear model→Multivariate (調(diào)用多元方差分析過程)Dependent variables: 選入day1-day5Fixed factors: groupContinueModel選中CustomModel框:groupContinuePost TocPost Toc Tests for: group選中LSD(選擇LSD為兩兩比較的方法,兩兩比較方法的選擇原則同單因素方差分析)
3 討 論
重復(fù)測(cè)量是指對(duì)同一觀察對(duì)象的同一觀察指標(biāo)在不同時(shí)間或環(huán)境下進(jìn)行的多次測(cè)量,用于分析觀察指標(biāo)的變化趨勢(shì)及有關(guān)的影響因素。臨床和基礎(chǔ)研究中常見這樣的設(shè)計(jì):中醫(yī)藥防治神經(jīng)退行性**的作用機(jī)制研究中,為了動(dòng)態(tài)觀察**對(duì)癡呆大鼠空間記憶能力的改善情況,測(cè)量大鼠在**前后不同時(shí)間(**前,**后1、2、3、4、5、6和7 d)進(jìn)行水迷宮實(shí)驗(yàn)的潛伏期;中西醫(yī)結(jié)合****,為了動(dòng)態(tài)觀察**方案對(duì)病人生命質(zhì)量的改善情況,測(cè)量病人**前后不同時(shí)間(**前,**后1個(gè)月、3個(gè)月、半年、1年和2年)的生命質(zhì)量量表的評(píng)分。此類設(shè)計(jì)均屬重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì),應(yīng)該考慮用重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)的方差分析方法。
就本文實(shí)驗(yàn)資料而言,若要對(duì)5個(gè)時(shí)間點(diǎn)上的測(cè)量結(jié)果進(jìn)行兩兩比較,由于各次測(cè)量結(jié)果間存在相關(guān),故不宜采用成組比較的t檢驗(yàn)方法或一般類型實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的單因素方差分析進(jìn)行兩兩比較,而應(yīng)使用重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)多重比較配對(duì)的t檢驗(yàn)法(Bonferroni法)。另外,可以采用重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的方差分析,用數(shù)學(xué)模型**地表達(dá)反應(yīng)變量隨時(shí)間的變化趨勢(shì),如建立多項(xiàng)式函數(shù)等。
水迷宮重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的方差分析及其在SPSS中的實(shí)現(xiàn)